পর্তুগালের রাজনৈতিক এবং ধর্মীয় ইতিহাসের বিচারে সময়টা খুব গুরুত্বপূর্ণ৷ কারণ রাজা ম্যানুয়েল বহিরাগত শরণার্থীদের যে ত্রিশ বছর সময় দিয়েছিলেন, সেবছর অর্থাৎ ১৫৩৪-এ সেই সময়সীমা শেষ হয়ে পর্তুগিজ ইনকুইজিশন শুরু হওয়ার কথা৷ এক ভয়ঙ্কর বস্তু এই ইনকুইজিশন৷ দেশের নাগরিকরা, বিশেষ করে ধর্মান্তরিত খ্রিস্টানরা সত্যিই খ্রিস্টানধর্ম পালন করছেন কি না সেই বিষয় অনুসন্ধান করে যে ধর্মীয় কমিটি, তাকে ইনকুইজিশন বলা হয়৷ ইনকুইজিশন যদি মনে করে, কোনও একজন সঠিক খ্রিস্টান নয় বা তাঁর ধর্ম পালন ঠিক হচ্ছে না, তাহলে সেই ব্যক্তিকে জ্যান্ত পুড়িয়ে মারার ক্ষমতা পর্যন্ত ছিল ইনকুইজিশনের৷ 'সাহেব পঞ্চবিংশতি' এ পরিচিত হন 'গার্সিয়া দা ওর্টা' র সাথে 'ডাক্তারবাবু ও ইনকুইজিশন' অধ্যায়ে।